原文作者：RoxanneKhamsi
研究人员正在创建一个体现全人类基因变化的人类“泛基因组”，然而不是每个人都想参与。
几年前，美国华盛顿大学的遗传学家EvanEichler彻底搜索了人类基因组中的未知变异，偶然获得了一些不寻常的发现。他的研究团队发现了一段长约40万个碱基的DNA，其中包含了额外的基因副本——很可能是从一个名为丹尼索瓦人的古人类群体遗传下来的[1]。这段DNA在约80%的巴布亚新几内亚居民体内存在，但别处几乎没有。
“这个长度太惊人了，”Eichler说，“我们一直知道，基因组中会有古老的片段。”但是这一片段的长度以及它在别处的缺失，“刷新了我们的想法”。
包括这一发现在内，一个个意想不到的发现，使得Eichler和其他遗传学家越来越无法满足于现有人类基因组图谱的广度和深度。第一版基因组图谱源自耗资27亿美元的人类基因组计划，在年发布，当时旨在成为未来基因研究的参考系（参见：解码20年，人类基因组计划带来哪些成果？）。但图谱中93%的序列仅来自11个人，这些人大多是通过纽约州水牛城的报纸广告招募的；高达70%的DNA都来自同一名男子。
插图：AnaKova
到了年，新版的参考基因组图谱GRCh38在技术上完成了，但它仍然包含数百段空缺和含有大量错误的部分。这些缺陷并非无关痛痒。Eichler与本校医学中心的临床遗传学家合作发现，该参考基因组缺少一个区域，其中包含与Baratela-Scott综合征相关的变异，该综合征可导致儿童认知迟滞和骨骼畸形。因为缺失这一块，医生无法快速检测出这里的DNA错误。
尽管基因组图谱有所改进，但还不能充分体现人类的巨大多样性。例如，年，一组研究人员对名非洲裔个体进行测序，发现了一段由3亿个DNA字母——或称为碱基——组成的陌生序列[2]，这大概是整个基因组的10%。
为了获得更完整、更有代表性的参考，Eichler与许多著名科学家（大多在美国）携手合作。他们的目标是尽量查明全部的人类基因变异——人类基因中数不胜数的“混音”，包括添加、缺失和其他类型的突变。
基因组不是来自单个个体的线性读数，它更像是包含着无穷分支与融合的多重路径，就像错综复杂的伦敦地铁线路图。这体现在不同人群中发现的序列多变性，例如巴布亚新几内亚许多人身上发现的那一大段DNA。
年，在美国国家人类基因组研究所（NHGRI）资助下，Eichler的团队启动了耗资万美元的人类泛基因组计划（HumanPangenomeProject）。最初的目标是对大约名不同背景的人进行参考级质量的详细基因组测序，并尽量自由共享这些数据。
这项工作提出了重大技术挑战，不过幕后的科学家们（包括加州大学的KarenMiga和华盛顿大学医学院的TingWang）感到大有可为。他们认为这是使基因组医学实现公平的关键[3]。“阐明多样性是为了以人为本，”Wang说，“宗旨是为了兼顾公正与平等，是为了建立服务人类的、更具包容性的基因组资源。”
泛基因组计划的研究人员反思了人类基因多样性研究的历史，有些研究项目采集边缘人群的数据却不尊重他们的需求与愿望，从而被视为“吸血鬼”项目。对此，泛基因组计划全程聘请生物伦理学家，而不是像过去那样隔段时间才邀请他们一回。“伦理学家们不会再闭目塞听、单独工作，而是参与到项目的每一步，包括所有的技术决策。”Wang说。
然而，一些
